Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN4Q8WUT4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms