Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MCOLN3Q8TDD5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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MCOLN3Q8TDD5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MCOLN3Q8TDD5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MCOLN3Q8TDD5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MCOLN3Q8TDD5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MCOLN3Q8TDD5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MCOLN3Q8TDD5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MCOLN3Q8TDD5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCOLN3Q8TDD5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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