Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD2

SP7, Transcription factor Sp7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP7Q8TDD2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ACMSD-201ENST00000356140 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ACMSD-202ENST00000392928 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 LECT2-201ENST00000274507 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP7Q8TDD2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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