Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms