Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms