Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CATSPER4Q7RTX7 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms