Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms