Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms