Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms