Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms