Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms