Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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