Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSPP1Q1MSJ5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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