Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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