Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PTPRNQ16849 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRNQ16849 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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