Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RTN1Q16799 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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RTN1Q16799 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTN1Q16799 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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