Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CTF1Q16619 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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CTF1Q16619 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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