Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms