Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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