Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HDAC1Q13547 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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