Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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