Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BNIP1Q12981 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BNIP1Q12981 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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