Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms