Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PTPRJQ12913 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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