Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms