Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM27E3Q08E93 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms