Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms