Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms