Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms