Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2BQ00403 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms