Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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