Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN2P57739 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN2P57739 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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