Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLE2P56282 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLE2P56282 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLE2P56282 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POLE2P56282 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLE2P56282 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLE2P56282 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POLE2P56282 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLE2P56282 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLE2P56282 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms