Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL23P55773 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL23P55773 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms