Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms