Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCA4P51532 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms