Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT8P50990 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT8P50990 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT8P50990 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT8P50990 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT8P50990 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT8P50990 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT8P50990 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT8P50990 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCT8P50990 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCT8P50990 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms