Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TCEAL1-202ENST00000372625 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms