Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK8P49336 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms