Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NESP48681 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NESP48681 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NESP48681 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NESP48681 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms