Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGP37231 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGP37231 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGP37231 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPARGP37231 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms