Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms