Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms