Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms