Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFNP31947 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFNP31947 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms