Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms