Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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