Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms