Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms