Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA4P22748 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA4P22748 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CA4P22748 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms